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Vídeo 2: Alineamiento de secuencias frente a genoma de referencia con datos de RNA-Seq o DNA-Seq: Parte II

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Técnicas de alineamiento de secuencias en proyectos de NGS, con un enfoque específico en la diferencia entre datos de RNA-Seq y DNA-Seq. PARTE 2: Uso de diferentes softwares de alineamiento dependiendo de la tecnología de interés. Utilidad de la formación: Alineamiento de datos RNA-Seq • Aprender las técnicas de alineamiento de lecturas de RNA-Seq para estudios de expresión génica. • Utilizar herramientas la herramienta HISAT2 para mapear lecturas de RNA a un genoma de referencia. • Evaluar la cantidad de lecturas mapeadas. Alineamiento de datos de DNA-Seq: • Aprender las técnicas de alineamiento de lecturas de DNA-Seq para estudios genoma completo o exoma. • Emplear herramientas como BWA para mapear secuencias de DNA frente a un genoma de referencia.

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